No ano de 1999 a Confederação Brasileira de Futebol decidiu criar uma competição para definir as equipes que disputariam a Taça Libertadores da América de 2001. O Brasil detinha quatro vagas, sendo uma da Copa do Brasil (campeão), duas do Campeonato Brasileiro (campeão e vice) e uma, em 99, do vencedor da Seletiva da Libertadores.

Para substituir a Seletiva, que não fez sucesso entre os clubes da entidade, a CBF criou a Copa dos Campeões, dividida em fazes regionais. Apesar de efetivamente jogada, a Copa Sul não concedeu vaga a Seletiva do ano nem para a Copa dos Campeões do ano seguinte, que foi definida (no caso do Sul) pela Copa Sul-Minas.

O torneio regional do Sul do Brasil foi o segundo oficial com a mesma característica, isso porque antes desse foi jogado, nos anos 60, o Campeonato Sul-Brasileiro, igualmente vencido pelo Grêmio.

A competição reuniu 12 times, sendo quatro do Rio Grande do Sul (Grêmio, Internacional, Juventude e Caxias), quatro de Santa Catarina (Criciúma, Tubarão, Figueirense e Avai) e quatro do Paraná (Coritiba, Paraná, Atlético Paranaense e Grêmio Maringá). As equipes foram divididas em três chaves de quatro clubes cada, os jogos da primeira fase foram disputados durante os meses de janeiro e fevereiro, em turno e returno, classificando-se o 1º e o 2º colocados de cada grupo.

O Grêmio conquistou a competição com 7 vitórias, 2 empates e 4 derrotas. Na final enfrentamos o Paraná que havia se classificado juntamente com Internacional na primeira fase e vencido Atlético Paranaense e Coritiba na fase seguinte. Foram jogados três jogos na disputa pelo título, sendo duas vitórias do Grêmio e uma do Paraná, demonstrando mais uma vez que o Tricolor Gaúcho quem manda no Sul do Brasil.